MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR9

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022608	T	6	6	630	635	0 %	100 %	0 %	0 %	554651120
2	NC_022608	AGC	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651120
3	NC_022608	A	7	7	653	659	100 %	0 %	0 %	0 %	554651120
4	NC_022608	TAA	2	6	669	674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651120
5	NC_022608	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651120
6	NC_022608	A	6	6	848	853	100 %	0 %	0 %	0 %	554651120
7	NC_022608	A	6	6	915	920	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
8	NC_022608	ATGA	2	8	949	956	50 %	25 %	25 %	0 %	554651121
9	NC_022608	TAAA	2	8	959	966	75 %	25 %	0 %	0 %	554651121
10	NC_022608	GAA	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651121
11	NC_022608	AAT	2	6	997	1002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651121
12	NC_022608	TTA	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651121
13	NC_022608	AAAAC	2	10	1034	1043	80 %	0 %	0 %	20 %	554651121
14	NC_022608	A	7	7	1061	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
15	NC_022608	A	6	6	1084	1089	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
16	NC_022608	A	6	6	1105	1110	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
17	NC_022608	TACTT	2	10	1119	1128	20 %	60 %	0 %	20 %	554651121
18	NC_022608	CTTT	2	8	1152	1159	0 %	75 %	0 %	25 %	554651121
19	NC_022608	GA	3	6	1212	1217	50 %	0 %	50 %	0 %	554651121
20	NC_022608	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	554651121
21	NC_022608	A	7	7	1251	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	554651121
22	NC_022608	CAT	2	6	2650	2655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651122
23	NC_022608	ACA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651122
24	NC_022608	AAAAGA	2	12	2809	2820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	554651122
25	NC_022608	AATT	2	8	2865	2872	50 %	50 %	0 %	0 %	554651122
26	NC_022608	CAG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651122
27	NC_022608	A	6	6	2907	2912	100 %	0 %	0 %	0 %	554651122
28	NC_022608	A	7	7	2975	2981	100 %	0 %	0 %	0 %	554651122
29	NC_022608	ATAG	2	8	3012	3019	50 %	25 %	25 %	0 %	554651122
30	NC_022608	GAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651113
31	NC_022608	TAA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
32	NC_022608	ATT	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
33	NC_022608	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
34	NC_022608	AAGT	2	8	3150	3157	50 %	25 %	25 %	0 %	554651113
35	NC_022608	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	554651113
36	NC_022608	CA	3	6	3196	3201	50 %	0 %	0 %	50 %	554651113
37	NC_022608	CTATT	2	10	3214	3223	20 %	60 %	0 %	20 %	554651113
38	NC_022608	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651113
39	NC_022608	TTA	3	9	3266	3274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
40	NC_022608	TGG	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554651113
41	NC_022608	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651113
42	NC_022608	A	7	7	3389	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	554651113
43	NC_022608	AT	4	8	3768	3775	50 %	50 %	0 %	0 %	554651123
44	NC_022608	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	554651123
45	NC_022608	AAC	2	6	3889	3894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
46	NC_022608	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651123
47	NC_022608	A	8	8	3996	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
48	NC_022608	A	6	6	4018	4023	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
49	NC_022608	AT	3	6	4044	4049	50 %	50 %	0 %	0 %	554651123
50	NC_022608	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
51	NC_022608	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
52	NC_022608	ACA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651123
53	NC_022608	ATT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
54	NC_022608	TAT	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651123
55	NC_022608	GAA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651123
56	NC_022608	A	7	7	4206	4212	100 %	0 %	0 %	0 %	554651123
57	NC_022608	ATG	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651124
58	NC_022608	TTG	2	6	4282	4287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
59	NC_022608	AATGCC	2	12	4291	4302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	554651124
60	NC_022608	T	6	6	4386	4391	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
61	NC_022608	CTG	3	9	4444	4452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651124
62	NC_022608	AC	3	6	4459	4464	50 %	0 %	0 %	50 %	554651124
63	NC_022608	TTG	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651124
64	NC_022608	T	8	8	4512	4519	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
65	NC_022608	TAT	2	6	4525	4530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
66	NC_022608	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651124
67	NC_022608	TA	3	6	4603	4608	50 %	50 %	0 %	0 %	554651124
68	NC_022608	TCATAT	2	12	4686	4697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554651124
69	NC_022608	TCT	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
70	NC_022608	TCT	2	6	4755	4760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
71	NC_022608	TCT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
72	NC_022608	AGTA	2	8	4901	4908	50 %	25 %	25 %	0 %	554651124
73	NC_022608	TTC	2	6	4916	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
74	NC_022608	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
75	NC_022608	TTC	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
76	NC_022608	CTT	2	6	4993	4998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651124
77	NC_022608	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	554651124
78	NC_022608	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651124
79	NC_022608	T	7	7	5089	5095	0 %	100 %	0 %	0 %	554651124
80	NC_022608	A	6	6	5171	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	554651125
81	NC_022608	TTAT	2	8	5177	5184	25 %	75 %	0 %	0 %	554651125
82	NC_022608	AAG	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651125
83	NC_022608	GCA	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651125
84	NC_022608	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
85	NC_022608	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651125
86	NC_022608	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
87	NC_022608	T	7	7	5485	5491	0 %	100 %	0 %	0 %	554651125
88	NC_022608	AT	3	6	5526	5531	50 %	50 %	0 %	0 %	554651125
89	NC_022608	ACA	3	9	5546	5554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651125
90	NC_022608	ATT	2	6	5561	5566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
91	NC_022608	ACATTT	2	12	5567	5578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	554651125
92	NC_022608	ATT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
93	NC_022608	TGT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554651125
94	NC_022608	ATT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
95	NC_022608	T	7	7	5694	5700	0 %	100 %	0 %	0 %	554651125
96	NC_022608	AAT	2	6	5716	5721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
97	NC_022608	TTA	2	6	5769	5774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651125
98	NC_022608	TAA	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651125
99	NC_022608	T	6	6	5809	5814	0 %	100 %	0 %	0 %	554651125
100	NC_022608	ATA	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
101	NC_022608	GTAG	2	8	6246	6253	25 %	25 %	50 %	0 %	554651114
102	NC_022608	A	8	8	6272	6279	100 %	0 %	0 %	0 %	554651114
103	NC_022608	TAC	2	6	6303	6308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651114
104	NC_022608	ATT	2	6	6321	6326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651114
105	NC_022608	GAA	2	6	6366	6371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554651114
106	NC_022608	TAAT	2	8	6394	6401	50 %	50 %	0 %	0 %	554651114
107	NC_022608	CAGAT	2	10	6466	6475	40 %	20 %	20 %	20 %	554651114
108	NC_022608	TAA	2	6	6617	6622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
109	NC_022608	TAA	2	6	6626	6631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651114
110	NC_022608	A	7	7	6653	6659	100 %	0 %	0 %	0 %	554651114
111	NC_022608	A	6	6	6667	6672	100 %	0 %	0 %	0 %	554651114
112	NC_022608	CAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554651115
113	NC_022608	A	6	6	7009	7014	100 %	0 %	0 %	0 %	554651115
114	NC_022608	TCG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651115
115	NC_022608	A	7	7	7031	7037	100 %	0 %	0 %	0 %	554651115
116	NC_022608	AGT	2	6	7064	7069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554651115
117	NC_022608	ATT	2	6	7116	7121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
118	NC_022608	GCAC	2	8	7215	7222	25 %	0 %	25 %	50 %	554651115
119	NC_022608	AGC	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554651115
120	NC_022608	A	6	6	7308	7313	100 %	0 %	0 %	0 %	554651115
121	NC_022608	ATT	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651115
122	NC_022608	CTG	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651126
123	NC_022608	TAT	2	6	7515	7520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651126
124	NC_022608	T	6	6	7563	7568	0 %	100 %	0 %	0 %	554651126
125	NC_022608	TA	3	6	7585	7590	50 %	50 %	0 %	0 %	554651126
126	NC_022608	TTC	2	6	7616	7621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554651126
127	NC_022608	TAA	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554651126
128	NC_022608	CAT	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554651126
129	NC_022608	AT	3	6	7642	7647	50 %	50 %	0 %	0 %	554651126
130	NC_022608	TAGT	2	8	7656	7663	25 %	50 %	25 %	0 %	554651126
131	NC_022608	GGTT	2	8	7664	7671	0 %	50 %	50 %	0 %	554651126
132	NC_022608	A	8	8	7680	7687	100 %	0 %	0 %	0 %	554651126
133	NC_022608	TAT	2	6	7921	7926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554651116
134	NC_022608	AAGCT	2	10	7974	7983	40 %	20 %	20 %	20 %	554651116
135	NC_022608	A	6	6	8021	8026	100 %	0 %	0 %	0 %	554651116
136	NC_022608	T	6	6	8030	8035	0 %	100 %	0 %	0 %	554651116
137	NC_022608	AACA	2	8	8081	8088	75 %	0 %	0 %	25 %	554651116
138	NC_022608	AT	3	6	8091	8096	50 %	50 %	0 %	0 %	554651116
139	NC_022608	CTG	2	6	8160	8165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554651116
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.